蛋白组学测序-多肽质谱检测

蛋白组学测序

近年来，随着质谱仪器灵敏度及检测通量的提升，蛋白测序技术也得到不断革新。科研工作者开始重视蛋白测序方法在生物医学研究领域的应用。上海基云生物蛋白测序技术涵盖常规蛋白质谱定性分析，多肽定性及定量分析，非标记差异蛋白定量Labelfree和标记差异蛋白定量，目标蛋白靶向验证MRM/PRM/SRM以及蛋白后修饰富集等各个层面。

每种蛋白测序技术都有其侧重点和特定应用范围，其中itraq/tmt和labelfree技术是目前比较主流的蛋白组学测序技术。今天主要讲解itraq/tmt技术的应用特点。

itraq技术简介

itraq技术英文全称“isobaric tags for relative and absolute quantitation”,中文译法“等重标签标记用于蛋白质相对和绝对定量技术”，它是美国ABsciex公司研发的蛋白组学测序专利技术，自2004年在美国质谱年会第一次被提出以来，已经成为目前经典的差异蛋白筛选技术，在动植物研究，药物耐药机制研究，疾病标志物发现等方面都有广泛的应用，相关的SCI论文发表数量也是逐年增加。
迄今为止，公司技术人员已先后为客户实施了包括人源组织（细胞）、小鼠、酵母、斑马鱼、乌龟、小麦、腾冲嗜热厌氧杆菌、土壤微生物、文蛤等近百种多种蛋白组学测序项目，在细胞核蛋白、细胞膜蛋白、细胞壁蛋白、外泌体、线粒体、叶绿体蛋白提取过程中积累了丰富的实践经验。

多年丰富的技术沉淀TECHNICAL PRECIPITATION

通量较高

一次实验可进行2-8个样品相对定量，适合如大量临床样本，多对照组实验等规模样本研究；

灵敏度高

可检测出较低丰度的蛋白；定性定量精度较高。是发现生物标记物的一种非常重要的蛋白组学测序方法；

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技术易操作

技术路线简单，不需要额外繁琐的操作；可以通过规范sop达到流程可追溯；

定性定量精度较高。

itraq和tmt分属不同的公司专利，技术成熟度较高，这种蛋白测序技术已经得到业内的认可。

适用范围

疾病标志物筛选植物抗逆研究
耐药机理研究 特定功能蛋白筛选

药物作用靶点研究

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样本要求

蛋白提取物：浓度>1μg/μl，蛋白质总量 >300μg；
       细胞样品：细胞量>10 7次方；
       组织样品：动物、微生物组织湿重>50mg | 植物组织>1000mg ；
       体液样品：血液体积>500μl。

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客户文献

【1】 Xiaping Zhang §, Xuefei Yin §, et al. Quantitative proteomic analysis of serum proteins in patients withParkinson’s disease using an isobaric tag for relative and absolute quantification labeling, two-dimensional liquidchromatography, and tandem mass spectrometry. Analyst, 2012,137,490. IF=3.9
【2】Q.Wang §, X.Su§, et al. iTRAQ technology-based identification of human peripheral serum proteins associated with depression. Neuroscience, 4 June 2016, doi:10.1016/j.neuroscience.2016.05.055. IF=3.38

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蛋白多肽质谱检测常见问题