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蛋白后修饰位点质谱鉴定服务概述
蛋白质后修饰位点鉴定是指对于客户提供的IP样本，蛋白混合物样本，SDS-PAGE泳道胶条样本，通过液质联用技术(LC-MS/MS)技术样本中发生修饰后修饰的肽段进行质谱检测，结合相关物种数据库检索，可以对目前已知的各种蛋白修饰类型（如磷酸化、乙酰化、泛素化、甲基化、亚硝基化和糖基化等）和一些小分子药物在蛋白上的修饰位点进行分析，找出肽段准确修饰位点，并提供具体修饰位点质谱谱图信息。
蛋白质翻译后修饰技术服务流程
蛋白质混合溶液或者胶条泳道
客户提供蛋白质混合液或胶条样本，回传需求单告知物种信息及修饰位点信息。
蛋白酶解
加胰蛋白酶酶切成肽段混合物
液质联用质谱分析
利用质谱仪得到二级质谱离子峰分布来鉴定样品中的肽段,进而鉴定蛋白种类。
数据库搜索
加特定蛋白质后修饰位点，确定目标蛋白样本后修饰位点鉴定列表。
修饰位点分析
根据客户沟通，进一步提供相关后修饰位点谱图
蛋白磷酸化位点鉴定
蛋白磷酸化修饰是最为广泛的蛋白翻译后修饰之一，是生物体内重要的共价修饰之一，与信号转导、细胞周期、生长发育以及癌症机理等诸多生物学问题密切相关，据估计细胞中1/3的蛋白同时发生磷酸化，所有的生命过程都通过磷酸化修饰直接或者间接的进行调控。鉴定蛋白质磷酸化位点有助于阐明蛋白质磷酸化的机制与生物学功能。目前，通过质谱技术（LC-MS/MS）是鉴定蛋白质磷酸化位点较为重要的方法之一。
根据客户磷酸化后修饰具体要求，公司将提供磷酸化富集等方法，提升磷酸化后修饰覆盖度，以期鉴定更多的蛋白磷酸化位点修饰。
蛋白泛素化位点修饰
泛素化修饰是一种重要的蛋白质翻译后修饰。泛素-蛋白酶体介导了真核生物体内80%~85%的蛋白质降解。另外，蛋白泛素化修饰还可以直接影响蛋白质的活性和定位，调控包括细胞周期、细胞凋亡、转录调控、DNA 损伤修复以及免疫应答等在内的细胞活动。
蛋白泛素化修饰分为两种，一种即是对常规蛋白质谱的泛素化修饰位点搜库分析，另一种是通过泛素化富集试剂盒对蛋白样本进行泛素化富集，提升泛素化后修饰覆盖度。结合LC-MS/MS蛋白质定量方法，实现泛素化蛋白质定性定量分析。
蛋白乙酰化后修饰 位点分析
“乙酰化”是改变蛋白质功能主要的修饰方式之一，最初发现它在组蛋白上比较丰富，主要调控基因的转录。乙酰类修饰的研究已经有40年的历史，但是研究一直停滞不前。这主要与乙酰化蛋白质比较隐蔽，不容易被发现有关。
2009年，复旦大学研究团队通过通量化的蛋白质研究和不同物种的代谢通路研究，成功发现了大量非细胞核的乙酰化蛋白质。在他们研究之前，人类在人体肝脏细胞中仅仅发现了76个乙酰化蛋白质，他们的研究发现了超过1000个乙酰化蛋白质。从而带出一系列有关乙酰化蛋白质革命性的研究成果，其中最重要的成果就是研究团队首次发现乙酰化对代谢的调控功能，这种代谢功能的载体就是蛋白质中的负责能量转化的酶。2010年2月19日出版的国际权威期刊《科学》杂志同时发表了两篇复旦大学IBS生物医学研究院的研究成果，并配发评论认为，该项研究开辟了生命代谢研究的新领域，为开发调控代谢的药物研究提供了新的思路，为包括肿瘤在内新的治疗手段发展提供了可能。而且细胞蛋白、代谢酶等大量非细胞核蛋白的乙酰化修饰，都是在研究中首次得到确认。